Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lysmd3Q99LE3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms