Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SardhQ99LB7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SardhQ99LB7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms