Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nmd3Q99L48 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms