Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlgn1Q99K10 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms