Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pacsin3Q99JB8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms