Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apobec3Q99J72 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms