Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms