Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ripply3Q924S9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ripply3Q924S9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms