Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sf3b5Q923D4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Sf3b5Q923D4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Sf3b5Q923D4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sf3b5Q923D4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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