Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpe65Q91ZQ5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpe65Q91ZQ5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms