Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Pde6cQ91ZQ1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pde6cQ91ZQ1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Pde6cQ91ZQ1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Pde6cQ91ZQ1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Pde6cQ91ZQ1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Pde6cQ91ZQ1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Pde6cQ91ZQ1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Pde6cQ91ZQ1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Pde6cQ91ZQ1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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