Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf6Q91YR7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms