Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Synpo2Q91YE8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Synpo2Q91YE8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms