Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx11Q91WL6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx11Q91WL6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms