Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms