Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp3Q91W36 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp3Q91W36 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp3Q91W36 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp3Q91W36 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp3Q91W36 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp3Q91W36 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp3Q91W36 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms