Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppargc1bQ8VHJ7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms