Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rprd1aQ8VDS4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms