Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VDP2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VDP2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VDP2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VDP2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VDP2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VDP2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VDP2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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