Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fyco1Q8VDC1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fyco1Q8VDC1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fyco1Q8VDC1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fyco1Q8VDC1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fyco1Q8VDC1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms