Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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