Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnajc28Q8VCE1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnajc28Q8VCE1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms