Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clptm1Q8VBZ3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clptm1Q8VBZ3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms