Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8R3C1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8R3C1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8R3C1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms