Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C0

Mcmbp, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
McmbpQ8R3C0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
McmbpQ8R3C0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
McmbpQ8R3C0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms