Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc12Q8R344 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc12Q8R344 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms