Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1U1

Cog4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog4Q8R1U1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog4Q8R1U1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog4Q8R1U1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms