Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms