Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hoxc12Q8K5B8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hoxc12Q8K5B8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hoxc12Q8K5B8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Hoxc12Q8K5B8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Hoxc12Q8K5B8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Hoxc12Q8K5B8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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