Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4T3

Stradb, STE20-related kinase adapter protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StradbQ8K4T3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
StradbQ8K4T3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
StradbQ8K4T3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
StradbQ8K4T3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
StradbQ8K4T3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
StradbQ8K4T3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
StradbQ8K4T3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
StradbQ8K4T3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
StradbQ8K4T3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
StradbQ8K4T3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
StradbQ8K4T3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms