Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpv3Q8K424 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms