Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28aQ8K3Y3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lin28aQ8K3Y3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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