Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casc3Q8K3W3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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