Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot6Q8K3P5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms