Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms