Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sde2Q8K1J5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms