Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c1Q8K193 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms