Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FgbQ8K0E8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgbQ8K0E8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms