Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkn3Q8K045 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms