Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ep400Q8CHI8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms