Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upp2Q8CGR7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms