Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdkl1Q8CEQ0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdkl1Q8CEQ0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms