Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc28aQ8CEI3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms