Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms