Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rdh13Q8CEE7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rdh13Q8CEE7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh13Q8CEE7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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