Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE8

Spdye4b, 4933411G11Rik protein, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdye4bQ8CDE8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Spdye4bQ8CDE8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Spdye4bQ8CDE8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Spdye4bQ8CDE8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Spdye4bQ8CDE8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Spdye4bQ8CDE8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Spdye4bQ8CDE8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Spdye4bQ8CDE8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Spdye4bQ8CDE8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Spdye4bQ8CDE8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Spdye4bQ8CDE8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Spdye4bQ8CDE8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4bQ8CDE8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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