Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A430089I19RikQ8C9W1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms