Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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Atg4aQ8C9S8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atg4aQ8C9S8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Atg4aQ8C9S8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Atg4aQ8C9S8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Atg4aQ8C9S8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Atg4aQ8C9S8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Atg4aQ8C9S8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg4aQ8C9S8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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