Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac7Q8C2B3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac7Q8C2B3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms