Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TiparpQ8C1B2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms